Affiliate linkovi mogu uticati na CTR AdSense oglasa, ali ne uvek direktno. Ako se pravilno koriste i balansiraju, affiliate linkovi i AdSense oglasi mogu koegzistirati bez većih problema. Ključ je u postavljanju linkova i oglasa tako da ne preopterećuju korisnike i ne smanjuju njihov interes za klikove na oglase. Idealno bi bilo da affiliate linkovi i AdSense oglasi budu jasno odvojeni i da se ne nadmašuju jedni druge, kako bi korisnici imali pozitivan i nenametljiv doživljaj.